这种星系是大小、形状或构造与众不同的星系，还有卫星星系

特殊星系是大小、形状或构造与众不同的星系。特殊星系通常是由两个星系之间的交互作用造成的，也许比典型的星系有更多的尘埃与气体，或是有较低的表面亮度，也或者有其他的特性，例如相对论性喷流。它们的形状由于和其他的星系遭遇，在巨大的引力下而呈现出高度的不规则性。

这一类星系的特殊性质主要是因星系核的活动和主星系同伴星系之间的相互扰动造成的。特殊星系可分为类星体、塞佛特星系、N型星系、射电星系、马卡良星系、致密星系、蝎虎座BL型天体、有多重核的星系和有环的星系等等。这些星系的命名，有的是根据历史情况，有的是根据星系特性，有的是根据发现者的名字而来的。已知上述各类星系之间有重叠、交错的情况。例如，马卡良星系中至少有10%可归入塞佛特星系，N型星系中有很多又属于射电星系。

有的特殊星系外围有伴星系(常形成扰动形态)，有的有外环，有的旋臂残缺。在射电图上，在一些射电星系外区，可以观测到相距很远的射电双子源或射电包层。绝大多数特殊星系都有核心区爆发遗留下来的痕迹:或是从中心向两个相反方向射出光学喷射物;或是向四面八方发散纤维状的稀薄气体;或是星系中心分裂;或是出现尘埃暗条。此外，有的还有不规则的电离氢区分布。